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北大生科院連發(fā)Cell,Nature子刊文章

2012-07-18 [2013]

近期北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院接連在Cell,Nature structural and molecular biology上發(fā)表文章,介紹了關(guān)于先天免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的重要接頭及感應(yīng)蛋白STING結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究成果,以及基因組穩(wěn)定性方面的研究成果。

在“The structural basis for the sensing and binding of cyclic di-GMP by STING”文章中,蛋白質(zhì)與植物基因研究國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及生物動(dòng)態(tài)成像中心(BIOPIC)蘇曉東教授研究組解析了先天免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的重要接頭及感應(yīng)蛋白STING(STimulator of INterferon Genes)胞內(nèi)部分的Apo蛋白及其與c-di-GMP(bis-(3’-5’)-cyclic dimeric GMP)復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。

STING堪稱“中國(guó)蛋白”之一,是2008年至2009年間由世界上多個(gè)科研小組(包括北京大學(xué)的蔣爭(zhēng)凡教授研究組,稱其為ERIS; 以及武漢大學(xué)舒紅兵院士研究組,稱其為MITA)幾乎同時(shí)發(fā)現(xiàn)的在先天免疫通路中起重要聯(lián)接及感應(yīng)功能的接頭蛋白。

STING是一個(gè)多次跨膜蛋白,進(jìn)一步研究還發(fā)現(xiàn)它可以直接感受并結(jié)合一類細(xì)菌*的第二信使信號(hào)分子,如c-di-GMP,從而介導(dǎo)激活下游信號(hào)傳導(dǎo)通路,進(jìn)而產(chǎn)生細(xì)胞因子及其它固有免疫反應(yīng),這是固有免疫中的一個(gè)全新概念。

通過(guò)結(jié)構(gòu)分析,研究人員發(fā)現(xiàn)先前預(yù)測(cè)的在不同物種中非常保守的第五個(gè)跨膜區(qū)實(shí)際上處于胞內(nèi),并且這個(gè)區(qū)域?qū)τ赟TING形成同源二聚化介導(dǎo)生物學(xué)功能至關(guān)重要,這一結(jié)果與蔣爭(zhēng)凡研究組以前的發(fā)現(xiàn)非常吻合。

并且結(jié)合與c-di-GMP復(fù)合物的結(jié)構(gòu)分析,研究人員提出,STING具有一個(gè)“蓋子”(lid)區(qū)域,在沒(méi)有結(jié)合c-di-GMP前,這個(gè)區(qū)域具有較高柔性,易于敞開(kāi);一旦感應(yīng)及結(jié)合c-di-GMP后,這個(gè)“蓋子”區(qū)域就會(huì)與其它部分一起形成更加穩(wěn)定的結(jié)構(gòu),非常牢固的結(jié)合c-di-GMP,復(fù)合物也進(jìn)一步穩(wěn)定了同源二聚體結(jié)構(gòu)。

這項(xiàng)研究通過(guò)對(duì)STING及其與c-di-GMP復(fù)合物結(jié)構(gòu)的解析,非常清楚地展示了STING感受和結(jié)合c-di-GMP的分子機(jī)制,為進(jìn)一步的免疫治療及c-di-GMP作為疫苗佐劑的開(kāi)發(fā)應(yīng)用提供了非常重要的線索。

另外一篇“The Intra-S Phase Checkpoint Targets Dna2 to Prevent Stalled Replication Forks from Reversing”文章中,北京大學(xué)孔道春課題組利用生物化學(xué)等方法篩選得到了一批S期細(xì)胞周期檢驗(yàn)點(diǎn)的靶蛋白。

S期細(xì)胞周期檢驗(yàn)點(diǎn)ATR-Chk2通路通過(guò)直接磷酸化Dna2在第220位的絲氨酸從而穩(wěn)定Dna2與停頓的DNA復(fù)制叉的結(jié)合,Dna2(a flap endonuclease)利用其能切割長(zhǎng)片段單鏈DNA翹起的核酸酶活性來(lái)切除停頓的DNA復(fù)制叉中的異常單鏈翹起結(jié)構(gòu),進(jìn)而防止復(fù)制叉的倒轉(zhuǎn)以維持復(fù)制叉穩(wěn)定。

這一新通路的發(fā)現(xiàn)解決了一個(gè)長(zhǎng)期懸而未決的問(wèn)題,即S期細(xì)胞周期檢驗(yàn)點(diǎn)是如何防止復(fù)制叉倒轉(zhuǎn)而穩(wěn)定停頓的DNA復(fù)制叉,并為DNA復(fù)制叉穩(wěn)定性的機(jī)理研究提供了新的方向,是該領(lǐng)域的重要突破之一。

他們進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)靶蛋白Dna2在維持DNA復(fù)制叉穩(wěn)定中起重要作用。如果Dna2蛋白缺失或功能變異,將導(dǎo)致DNA復(fù)制叉倒轉(zhuǎn)并大量積累。倒轉(zhuǎn)的DNA復(fù)制叉是一種病理結(jié)構(gòu),會(huì)導(dǎo)致DNA復(fù)制叉垮塌或DNA斷裂,進(jìn)而引起DNA復(fù)制不能完成或基因組重排。