合成記憶環(huán)在酵母細(xì)胞中
合成生物學(xué)是一個令人無法置信的、激動人心的領(lǐng)域。與其他新生領(lǐng)域一樣,合成生物學(xué)到底是怎樣還存在一些不確定方面。問及任何三個科學(xué)家這個詞語的定義,你可能得到四種答案。 哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員成功在酵母細(xì)胞中合成了一種以DNA為基礎(chǔ)的記憶環(huán)。這一成果標(biāo)志著人們向著合成生物學(xué)領(lǐng)域又前進(jìn)了重要一步。
在利用隨機(jī)的DNA小片斷構(gòu)建出基因后,Pamela Silver教授的實(shí)驗(yàn)室的研究人員不但重構(gòu)了基因的動態(tài)過程,而且還創(chuàng)造出了一種能夠預(yù)測記憶如何接收的數(shù)學(xué)模型。這項(xiàng)研究的結(jié)果發(fā)表在9 月15日的Gene and Development雜志上。
一些人認(rèn)為合成生物學(xué)是促進(jìn)生物技術(shù)產(chǎn)品制造的方法,而另外一些人則認(rèn)為是創(chuàng)造可能繞過繁瑣的臨床試驗(yàn)步驟的計(jì)算機(jī)平臺。
由Caroline Ajo-Franklin領(lǐng)導(dǎo)的研究組不但希望能夠構(gòu)建遺傳物質(zhì)環(huán)路,而且還希望能夠建立具有預(yù)測功能的數(shù)學(xué)模型。
研究人員建立的這個記憶環(huán)的成份很簡單,就是兩個編碼蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)錄因子)的基因。轉(zhuǎn)錄因子能調(diào)節(jié)基因活性。他們將這兩個新合成的轉(zhuǎn)錄因子編碼基因放入一個酵母細(xì)胞中,然后讓細(xì)胞接觸半乳糖。*個基因被設(shè)計(jì)成在接觸半乳糖時開啟表達(dá),并產(chǎn)生一種能夠附著并活化第二個基因的轉(zhuǎn)錄因子。這就是反饋環(huán)路的開始。
第二個基因還能產(chǎn)生一種轉(zhuǎn)錄因子。但這個轉(zhuǎn)錄因子就好像一個回力棒一樣,能夠來回?fù)u擺并結(jié)合到同一個基因。這使得這個基因再次產(chǎn)生相同的轉(zhuǎn)錄因子,再一次繞回去、再次活化基因。也就是說,第二個基因能夠通過它創(chuàng)造出的轉(zhuǎn)錄因子來連續(xù)開啟自己。
接著,研究人員除去半乳糖使得*個基因被關(guān)閉,即使這樣,這個反饋環(huán)路仍然繼續(xù)運(yùn)行。
此前,來自日本和意大利的化學(xué)家報道說發(fā)明出一種自我推進(jìn)的油滴,該發(fā)明可能為給予人造細(xì)胞運(yùn)動的能力奠定了基礎(chǔ)。這項(xiàng)油東京大學(xué)和Protolife in Venice大學(xué)進(jìn)行的合作研究結(jié)果將發(fā)表在8月8日的Journal of the American Chemical Society。
Tadashi Sugawara和同事介紹說,他們的創(chuàng)造人造細(xì)胞研究的一部分焦點(diǎn)是遺傳學(xué)和使這種能夠變成生物染料工廠以及具有其他技術(shù)優(yōu)勢的細(xì)胞。Sugawara的研究組之前在JACS雜志上報道了他們發(fā)明的一種自我再造的脂質(zhì)膠囊。
這項(xiàng)新的研究則將焦點(diǎn)放在了另外一個關(guān)鍵并可能更基礎(chǔ)的細(xì)胞特征上,即運(yùn)動能力。在實(shí)驗(yàn)中,研究人員證實(shí)一種油滴能夠在一種化學(xué)溶液中運(yùn)動數(shù)分鐘直至zui終到達(dá)一個“站點(diǎn)”。研究人員解釋說,這種油滴證實(shí)了一種原始形式的趨化現(xiàn)象——基礎(chǔ)細(xì)胞應(yīng)答中的一種現(xiàn)象,細(xì)胞據(jù)此向著環(huán)境中特定的化合物運(yùn)動。這項(xiàng)研究可能為將來設(shè)計(jì)人造細(xì)胞的運(yùn)動系統(tǒng)。
另外,來自美國的基因組學(xué)研究的大師、先鋒級人物Craig Venterzui近又展示了他的技能——“細(xì)菌煉金術(shù)”,即利用“基因組移植”方法將一個細(xì)菌種變成另外一種細(xì)菌。這項(xiàng)進(jìn)展是向著Venter教授的創(chuàng)造合成生命形式的目標(biāo)前進(jìn)的又一重要步驟。